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悠遊卡公司表示，近期悠遊卡公司設定團體或個人購買悠遊卡如若超過50張或50萬，均需登錄相關控管資料，目前已請顧問針對防制洗錢的一些風險評估與制度協助導入。
根據金管會近期針對《金融機構防制洗錢辦法》草案的聲明預告，只要持新台幣50萬元及等值外幣以上的現行臨時性交易、購買50張電子票證及辦理新台幣3萬元以上的跨境匯款時，都要出示證件以示身分證明，其適用對象擴及券證券期貨業、保險業、電子支付機構及電子票證發行機構。
對洗錢防制的風險評估，悠遊卡公司認為，以悠遊卡單價100元算是很低，要從事洗錢，應不太會選擇悠遊卡，因為必須要非常大量的採購，才有洗錢的效益，而悠遊卡的訂單來說，一次採購50萬以上並不多，部分企業會選擇悠遊卡來做為企業禮品，多半是以匯款方式處理，只要有匯款就會有資料留下，不是現金採購，且次數並不是很頻繁。
但悠遊卡公司也表示，不會因為悠遊卡單價低，不適合做為洗錢的工具而撇除可能會遭有心人士洗錢的疑慮，因此，已請顧問針對洗錢的防制做風險評估。
根據悠遊卡公司統計，目前悠遊卡發行量多達六千萬張，多半是悠遊卡公司自己發行後，委託通路商製作，除了企業禮品的採購上會有訂單，一般來說，大量採購的部分較為少。